Justa la razón y temeraria la voluntad, el descubridor litigó sus imprescriptibles derechos y privilegios pactados contractualmente en Santa Fe de Granada el 30 de abril de 1492, hasta su deceso, acaecido en Valladolid, el 20 de mayo de 1506, después de haber otorgado, por medio de acto auténtico su postrera voluntad, y entre otras disposiciones, la de que sus restos fueran enterrados en La Española. Años más tarde, luego de numerosas e injustificadas dilatorias, sus despojos mortales fueron traídos a la ciudad de Santo Domingo por la Virreina del Alcázar de Colón.